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网站引物设计权威发布_查引物的网站(2024年11月精准访谈)

内容来源：北京东为网络所属栏目：观点更新日期：2024-11-27

网站引物设计

网络药理学分析药物靶点：从基因到PCR 大家好，我现在遇到了一点小麻烦，希望有经验的朋友能帮我解答一下。老师让我结合网络药理学来分析药物的潜在靶点，具体来说，就是要在PubMed上搜索这些靶点相关的基因。可是，我用genecard搜索的时候，出来的结果都是基因，而不是老师希望的靶点。我是不是理解错了老师的意图？我现在要做PCR，但不知道该怎么做，求大家指导一下！𐟙 根据老师的指示，我需要先通过网络药理学分析找出最可能的靶点，然后结合这些靶点分子的文献，挑选出10个基因。接下来就是做PCR了，订引物的时候，网上有很多引物设计网站，大家有没有推荐的？希望有经验的朋友能帮我解答一下，真的很急！𐟙

𐟧쐃R与RT-PCR的探秘之旅𐟔 𐟔쥜觔Ÿ物技术的广阔天地里，PCR与RT-PCR都是不可或缺的工具。最近，我深入探索了这两种技术，尤其是RT-PCR，它究竟有何魅力呢？ 𐟒ᩦ–先，RT-PCR与PCR的融合，使得在单个EP管中就能完成逆转录和聚合酶链式反应，这无疑大大简化了操作步骤。然而，这一步也带来了不小的挑战。每次转录一个RNA分子就需要消耗一个逆转录酶，这无疑增加了实验的成本和复杂性。 𐟓š在NCBI的网站上，我找到了许多关于RT-PCR的详细资料。虽然我在理解引物设计方面还有一些疑惑，比如如何选择合适的exon-exon进行设计，以及克隆时如何间接设计引物等。但我相信，随着不断的探索和学习，这些难题都将迎刃而解。 𐟒ꦀ𛧚„来说，RT-PCR以其独特的优势在生物技术领域占据了一席之地。虽然它的一些缺点也让实验者头疼不已，但正是这些挑战激发了我们的探索欲望。 𐟔–PS：在学习之余，也别忘了欣赏一下美丽的风景，比如《铃芽之旅》中的美景，它们也能给我们的心灵带来愉悦和放松哦！

如何设计qPCR引物：实用指南大家好！今天我们来聊聊如何设计qPCR（定量PCR）的引物。其实，qPCR的引物设计和普通PCR差别不大，都可以用NCBI来方便地设计。不过，由于qPCR鉴定的是mRNA的表达，所以在设计引物时需要特别注意以下几点：第一步：打开NCBI 首先，打开NCBI（美国国立生物技术信息中心）网站，搜索你需要的基因（例如Lepr）。第二步：找到基因卡片点开基因卡片，找到最下方的mRNA和Protein描述。根据你的需求选择合适的Isoform，然后复制NM码。第三步：进入引物设计页面在NCBI的引物设计（Primer design）栏目输入刚才复制的NM码。我个人更喜欢下载cDNA文件，然后用SnapGene手动拉取引物，这样可以直接看到cDNA序列，更加直观。第四步：确认引物CG值在SnapGene中确认引物的CG值（大约50%），Tm值在60度左右。可以多设计几对引物，以防有些引子不工作。希望这些小技巧能帮到大家，祝科研顺利！𐟒ꀀ

𐟧쥼•物设计全攻略✨ 𐟔 打开PubMed网站，点选NIH，开始你的基因探索之旅！ 𐟒ᠩ€‰择“Gene”，输入你心仪的目的基因，比如mouse、rat或human哦～ 𐟑€ 点击基因名字，进入下一步，别急！ 𐟌 点击NCBI，连接世界基因库，轻松获取信息。 𐟓– 在mRNA and protein区域，找到并点击第一个序号。 𐟒𜠧‚𙥇𛃄S，进入关键步骤，别错过！ 𐟓 复制棕色序列，一定要全部复制，这是关键数据哦！ 𐟚€ 打开生工网站，选择技术服务-常规引物合成，开始你的引物设计之旅！ 𐟖寸点击在线生成引物，选择SYBR，让引物设计更精准。 𐟌 选择物种，输入基因名称，粘贴刚才复制的序列，提交你的设计！ 𐟎‰ 在引物设计列表中查看已提交的序列，等待奇迹出现吧！

𐟌𑠥𜕧‰騮𞨮᥅覔𛧕导š从理论到实践！引物设计的基本原则 𐟓œ 选择目的基因的共有外显子区域进行设计。引物长度建议在20到25bp之间，GC含量保持在40%到60%，Tm值最好在60℃左右。设计引物时，尽量跨越外显子，上下游引物可以位于不同的外显子上。引物的self complementarity和self 3' complementarity相加值应不超过8，单个值不超过5。扩增产物长度建议在80到300bp之间，最佳为80到150bp。避免设计含有4个或以上相同碱基（如AAAA、TTTT、GGGG、CCCC）的引物，以及避免明显的二级结构。设计流程 𐟖寸使用NCBI在线设计工具：进入NCBI网站，搜索目的基因（如GAPDH）。查看详细信息，找到共有外显子区域。选择转录本信息，查看外显子位置。进入引物设计页面，填写相关信息。设置引物参数，如PCR产物大小、跨越外显子等。点击“Get Primers”获取引物序列。结果解读 𐟓Š 在Graphical view of primer pairs部分查看每对引物跨越外显子的情况。在Detailed primer reports部分查看引物质量和匹配情况。通过以上步骤，你就可以轻松完成引物设计啦！𐟎‰

如果研一的时候，有人告诉我这些就好了嘿，大家好！今天想跟大家分享一些我在研究生期间发现的宝藏工具，真的是科研路上的好帮手。如果有人在我研一的时候告诉我这些，估计我的科研之路已经成功一半了！ 1⃣️ 分子生物学软件：SnapGene 首先推荐的是SnapGene，这个软件真的是分子生物学实验员的必备神器。举个例子，以前设计一对引物需要花二十分钟，还得反复比对，生怕出错。现在有了SnapGene，一分钟就能设计出5对引物，效率提升不是一点点。 2⃣️ 数据分析软件：GraphPad 和 Origin 接下来是数据分析软件。GraphPad Prism8和Origin是我常用的两款。特别是GraphPad，做科研汇报和论文作图简直必备。以前我只会用Office作图，质量差不说，放到PPT上还不清晰，经常要改来改去。现在有了GraphPad，作图效率和质量都大大提升。 3⃣️ 修图排版软件：PS和AI 然后是修图和排版软件。Adobe Photoshop和Illustrator真的是绝配。论文图片的排版、修图微调都可以用这两个软件搞定。我自己写论文的时候，也是借助这两个软件进行排版设计的，方便又高效。 4⃣️ 实验protocol查询网站最后分享几个靠谱的实验protocol查询网站。Bio-protocol支持中文，很多protocol都是中文的，非常好用。Nature Protocols、Cold Spring Harbor Protocols、JOVE视频教程、Current Protocols和ProtocolExchange都是非常权威的网站，基本上在实验室里导师没时间教你，师兄师姐不一定会的小技巧都能在这些网站上查到。文献阅读小技巧最后给大家一些文献阅读的小技巧：文献查找分类：知网、谷歌学术、SCI-Hub、Web of Science、Pub Med等都是常用的检索工具。文献泛读：先检索100-200篇相关文献，一般只看abstract部分，然后用有道翻译提炼重点，筛出20-30篇精读。文献精读：先看abstract掌握主要思路，再看result了解作者观点，最后找出创新点，得到属于自己的ideas。希望这些小工具和小技巧能帮到大家，让你们的科研之路少走弯路！如果你们有其他好用的软件或者工具，也欢迎在评论区分享哦！

研0小白的引物设计之路：从零开始摸索实验 𐟔 被引物设计困扰的一天加入课题组已经三个月了，但我对实验流程的了解还不够深入。临近开学，我开始感到焦虑。最近，我决定尝试设计一个目的基因的引物，看看是否能得到一些结果。第一步就是订购引物。 𐟓… 实验的初步尝试上午，我在小破站和百度上看了很多关于如何设计引物的教程，希望能找到最佳的引物设计方法。下午，我尝试使用各种在线工具来筛选和验证引物的特异性。我还向师兄师姐们请教了相关问题。尽管在订购环节遇到了小麻烦，因为周末生工不上班，但我还是学会了如何筛选和设计引物，这让我感到非常有成就感。 𐟓 引物设计的方法总结在ncbi.nlm.nih.gov网站上查询基因序列，选择human的基因，找到NM号，点击右侧的“pick primers”，设定产物大小为80-250bp（推荐80-150bp），Tm值设定为60℃，选择跨外显子，提交后会出现10个引物，选择长度在18-24bp之间，GC%在40%-60%之间，self complementarity小于5的引物进行blast验证。在primerbank中查找已有的引物，然后进行blast验证。使用primer3plus工具设计引物，需要从ncbi中复制CDS序列，设计出引物后进行blast验证。 𐟔젦Ž夸‹来的实验计划接下来，我将收集血标本进行mRNA测序，并学习数据分析方法，看看这个基因的选择是否合适。虽然今天被引物设计困扰了一天，但我也学到了很多新知识，这让我对接下来的实验充满了期待。

实验室必备：荧光素光谱查询网站推荐 𐟌ˆ 探索荧光素的光谱世界，一个隐藏在实验室角落的宝藏网站！ 𐟌Ÿ 直观展示发射光谱，帮助你预判荧光素之间的干扰。 𐟔 网站功能强大，可以查询激发光谱和发射光谱，为你的实验提供有力支持。 𐟓Š 网站特色： Combined Ex/Em Graph：结合激发和发射光谱图形，一目了然。 Reset Zoom：调整波长范围，方便查看不同波段的光谱。 Wavelength(nm)：显示波长，帮助你精确定位。 Fluorochromes：列出各种荧光素，方便选择和查询。 Name：为每种荧光素提供名称，方便记忆。 QSearch Fluorochrome：快速搜索特定荧光素。 Save Combination：保存你常用的光谱组合，方便后续使用。 Clear：一键清除所有光谱，轻松开始新查询。 E：激发光谱，Em：发射光谱，Delete：删除不需要的光谱。 𐟔砥𗥥…𗦠功能： Fuorochromes Added：显示已添加的荧光素数量。 Alexa Fluor488：特定荧光素的详细信息。 Alexa Fluor647：更多荧光素的选择。 𐟓š 其他实验室工具网站推荐：实验室没人告诉你的搜论文图片网站实验室没人告诉你的引物网站实验室没人告诉你的搜小分子药物网站实验室没人告诉你的辅助综述网站 𐟔젥ꌦŠ€巧合集： aqPCR合集 ImageJ合集 WB合集石蜡切片和冰冻切片合集

𐟧챐CR引物设计全攻略✨ 𐟔 想要进行qPCR实验，引物设计是关键一步！别担心，我们为你提供了详细的引物设计方法。 1️⃣ 选择合适的基因和种属：首先，你需要确定你想要检测的基因和实验动物种类。比如，如果你正在研究小鼠的某个基因，那么就选择小鼠作为种属。 2️⃣ 查找基因信息：通过NCBI等数据库，你可以轻松找到所需基因的详细信息。确保输入正确的基因名称和种属，然后点击搜索。 3️⃣ 进入引物获取界面：在NCBI等网站上，你可以找到“pickprimers”等选项，点击进入引物获取界面。在这里，你可以根据需要调整引物长度、产物长度等参数。 4️⃣ 选择合适的引物序列：在引物获取界面，你会看到多个引物序列供你选择。选择合适的引物序列是确保实验成功的重要一步。你可以根据引物序列的GC%、Self complementarity等指标来评估其质量。 5️⃣ 验证引物特异性：在购买引物后，一定要进行特异性验证。你可以通过琼脂糖凝胶电泳、测序等方法来验证引物的特异性。如果发现曲线不佳或存在非特异性扩增，则需要重新设计引物。 𐟒ᠥ𜕧‰騮𞨮ᥰ贴士： - 引物长度一般在18-25nt，太短可能导致非特异性高。 - 产物长度一般在80-200bp，太长可能影响实验效率。 - 前后引物的Tm值应尽量接近，一般选择58-62℃。 - GC%一般在40-60%之间，太高可能不易打开，效率低。 𐟎‰ 现在，你已经掌握了qPCR引物设计的全部流程！赶快试试吧！

生工PCR引物订购全攻略𐟓 嘿，大家好！今天我们来聊聊如何在生工订购PCR引物。这个过程其实挺简单的，但为了确保大家不踩坑，我会详细讲解一下。订购前的准备工作𐟧슩斥…ˆ，你得知道你要订购的基因序列。生工提供了多种引物类型，比如常规引物、NGS引物等等。记住，正链和反链是要分开订购的哦！如何添加引物到购物车𐟛’ 这个步骤有点关键。你需要在生工的网站上找到“在线订购”部分，然后选择“添加引物”。接下来，你会看到一个页面让你输入引物的相关信息，比如名称、序列等等。填完这些信息后，点击“确定”，引物就会被添加到你的购物车里了。购物车管理𐟛’ 如果你还想继续添加其他引物，可以在弹出的提示中选择“取消”，然后继续添加。全部添加完成后，选择“确定”并去结算。这里要注意的是，计量单位为OD时只支持干粉交付方式哦！结算和支付𐟒𐊥œ訴�騽橡𕩝⯼Œ你可以看到所有引物的详细信息，包括单价、总价等等。确认无误后，选择“去结算”，然后按照提示完成支付。支付成功后，你的订单就正式生成了。其他注意事项⚠️ 在订购过程中，如果有任何问题，可以随时联系生工的客服。他们会很乐意帮你解决问题。另外，记得查看积分优惠券，有时候可以省下不少钱哦！好了，这就是在生工订购PCR引物的全部流程。希望对大家有所帮助！如果有任何问题，欢迎留言讨论！𐟓退

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