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有哪些引物设计网站直播_有哪些引物设计网站最好(2024年12月全新视觉)

内容来源：北京东为网络所属栏目：导读更新日期：2024-11-30

有哪些引物设计网站

网络药理学分析药物靶点：从基因到PCR 大家好，我现在遇到了一点小麻烦，希望有经验的朋友能帮我解答一下。老师让我结合网络药理学来分析药物的潜在靶点，具体来说，就是要在PubMed上搜索这些靶点相关的基因。可是，我用genecard搜索的时候，出来的结果都是基因，而不是老师希望的靶点。我是不是理解错了老师的意图？我现在要做PCR，但不知道该怎么做，求大家指导一下！𐟙 根据老师的指示，我需要先通过网络药理学分析找出最可能的靶点，然后结合这些靶点分子的文献，挑选出10个基因。接下来就是做PCR了，订引物的时候，网上有很多引物设计网站，大家有没有推荐的？希望有经验的朋友能帮我解答一下，真的很急！𐟙

如果研一的时候，有人告诉我这些就好了嘿，大家好！今天想跟大家分享一些我在研究生期间发现的宝藏工具，真的是科研路上的好帮手。如果有人在我研一的时候告诉我这些，估计我的科研之路已经成功一半了！ 1⃣️ 分子生物学软件：SnapGene 首先推荐的是SnapGene，这个软件真的是分子生物学实验员的必备神器。举个例子，以前设计一对引物需要花二十分钟，还得反复比对，生怕出错。现在有了SnapGene，一分钟就能设计出5对引物，效率提升不是一点点。 2⃣️ 数据分析软件：GraphPad 和 Origin 接下来是数据分析软件。GraphPad Prism8和Origin是我常用的两款。特别是GraphPad，做科研汇报和论文作图简直必备。以前我只会用Office作图，质量差不说，放到PPT上还不清晰，经常要改来改去。现在有了GraphPad，作图效率和质量都大大提升。 3⃣️ 修图排版软件：PS和AI 然后是修图和排版软件。Adobe Photoshop和Illustrator真的是绝配。论文图片的排版、修图微调都可以用这两个软件搞定。我自己写论文的时候，也是借助这两个软件进行排版设计的，方便又高效。 4⃣️ 实验protocol查询网站最后分享几个靠谱的实验protocol查询网站。Bio-protocol支持中文，很多protocol都是中文的，非常好用。Nature Protocols、Cold Spring Harbor Protocols、JOVE视频教程、Current Protocols和ProtocolExchange都是非常权威的网站，基本上在实验室里导师没时间教你，师兄师姐不一定会的小技巧都能在这些网站上查到。文献阅读小技巧最后给大家一些文献阅读的小技巧：文献查找分类：知网、谷歌学术、SCI-Hub、Web of Science、Pub Med等都是常用的检索工具。文献泛读：先检索100-200篇相关文献，一般只看abstract部分，然后用有道翻译提炼重点，筛出20-30篇精读。文献精读：先看abstract掌握主要思路，再看result了解作者观点，最后找出创新点，得到属于自己的ideas。希望这些小工具和小技巧能帮到大家，让你们的科研之路少走弯路！如果你们有其他好用的软件或者工具，也欢迎在评论区分享哦！

RNA扩增失败？六大原因揭秘！在进行RNA的PCR扩增时，如果操作无误，但扩增不成功，可能是以下原因导致的： 𐟔 细胞类型选择不当：如果选择的细胞不表达目的基因或表达量很低，扩增自然不成功。此时，需要检查目的基因在哪些细胞中表达，挑选表达量较高的细胞，重新提取RNA并进行反转录和PCR扩增。 𐟒Š 诱导表达不足：如果目的基因在天然状态下表达量很低，但可以在某些信号刺激下诱导表达，可以先用刺激物处理细胞，诱导目的基因大量表达，再提取RNA并进行反转录和PCR扩增。例如，干扰素刺激基因在Poly(I:C)刺激后容易扩增。 𐟔„ RNA提取问题：如果RNA提取步骤不当，导致RNA质量或浓度不高，可以优化提取步骤，提高RNA质量或浓度，增加模板量进行PCR扩增。 𐟔„ 长片段PCR：如果目的基因太长，可以将目的基因分成两段进行PCR，然后通过overlap将两个片段连接起来。 𐟔 引物设计问题：有时目的基因在N端或C端的G/C含量异常，导致没有合适的引物。可以先从其他位置设计引物将目的基因扩增出来，再设计新的引物将G/C含量异常的片段放到引物末端突出位置，以第一轮PCR的产物为模板进行第二轮PCR。 𐟔 引物不特异：设计的引物不特异，可以回收目的基因大小的片段，或在平板上多挑几个克隆测序，其中可能有需要的基因（当然也会混杂其他不需要的基因）。 𐟔„ PCR片段短于预期：如果引物特异，PCR条带很亮但短于预期，可能是扩增了不同的转录本（isoform）。如果测序发现短的不多，可以将缺失的片段设计到引物上，通过PCR将缺失的片段插入全长。如果重复多次都是缺失较长的片段，可以换不同的细胞系提RNA反转录后再PCR。 𐟔„ 长基因扩增困难：一般大于3000 bp的基因从细胞里扩增较难，短于1500 bp的通常都很好扩增。希望这些信息能帮助你解决PCR扩增不成功的问题！

如何设计qPCR引物：实用指南大家好！今天我们来聊聊如何设计qPCR（定量PCR）的引物。其实，qPCR的引物设计和普通PCR差别不大，都可以用NCBI来方便地设计。不过，由于qPCR鉴定的是mRNA的表达，所以在设计引物时需要特别注意以下几点：第一步：打开NCBI 首先，打开NCBI（美国国立生物技术信息中心）网站，搜索你需要的基因（例如Lepr）。第二步：找到基因卡片点开基因卡片，找到最下方的mRNA和Protein描述。根据你的需求选择合适的Isoform，然后复制NM码。第三步：进入引物设计页面在NCBI的引物设计（Primer design）栏目输入刚才复制的NM码。我个人更喜欢下载cDNA文件，然后用SnapGene手动拉取引物，这样可以直接看到cDNA序列，更加直观。第四步：确认引物CG值在SnapGene中确认引物的CG值（大约50%），Tm值在60度左右。可以多设计几对引物，以防有些引子不工作。希望这些小技巧能帮到大家，祝科研顺利！𐟒ꀀ

𐟧쐃R与RT-PCR的探秘之旅𐟔 𐟔쥜觔Ÿ物技术的广阔天地里，PCR与RT-PCR都是不可或缺的工具。最近，我深入探索了这两种技术，尤其是RT-PCR，它究竟有何魅力呢？ 𐟒ᩦ–先，RT-PCR与PCR的融合，使得在单个EP管中就能完成逆转录和聚合酶链式反应，这无疑大大简化了操作步骤。然而，这一步也带来了不小的挑战。每次转录一个RNA分子就需要消耗一个逆转录酶，这无疑增加了实验的成本和复杂性。 𐟓š在NCBI的网站上，我找到了许多关于RT-PCR的详细资料。虽然我在理解引物设计方面还有一些疑惑，比如如何选择合适的exon-exon进行设计，以及克隆时如何间接设计引物等。但我相信，随着不断的探索和学习，这些难题都将迎刃而解。 𐟒ꦀ𛧚„来说，RT-PCR以其独特的优势在生物技术领域占据了一席之地。虽然它的一些缺点也让实验者头疼不已，但正是这些挑战激发了我们的探索欲望。 𐟔–PS：在学习之余，也别忘了欣赏一下美丽的风景，比如《铃芽之旅》中的美景，它们也能给我们的心灵带来愉悦和放松哦！

转录组学揭秘：基因表达之谜 𐟓š 转录组学与RNAseq技术 𐟓Œ 基因组是指对整个细胞DNA进行测序得到的数据，而转录组则是通过RNA测序得到的。基因的表达受到时间和空间的严格调控。为了研究疾病的发生过程、胚胎的发育过程或器官的再生过程，最直接的方法是比较这些事件前后基因表达的变化。 𐟔젒NAseq技术需要首先从组织样本中提取RNA。由于mRNA具有特殊的polyA尾巴结构，可以通过设计针对PolyA尾巴的引物来富集mRNA。然后，通过逆转录的方式将mRNA转化为cDNA文库，最后将cDNA文库送去测序。 𐟒𛠦𕋥𚏧𛓦žœ会通过生物信息学工具比对到基因组上，确定这些转录本属于哪些基因。定量分析后，可以看到不同基因的表达量变化。

PCR实验全攻略：从引物设计到结果分析大家好！今天我们来聊聊分子克隆中的PCR实验。上一期我们已经介绍了引物设计的基础知识，这一期我们就来聊聊PCR的具体操作步骤。 PCR反应体系：你需要准备什么？𐟧ꊊ首先，PCR反应体系需要哪些东西呢？每个实验室用的酶可能都不一样，所以最好还是看看你实验室用的酶的说明书。以下是一个常见的2㗐hanta Flash Master Mix酶的加样体系：先加水：提前计算好每个样品的加水量，然后从大体积开始加，这样更准确。加酶：根据说明书上的推荐量加入。加引物：根据引物的浓度来决定。加模板：如果是基因组或菌体，变性时间3分钟；如果是质粒或片段，变性时间30秒。 PCR反应程序设置：如何设置？𐟓Š PCR反应程序的设置也是关键。以下是一个常见的2㗐hanta Flash Master Mix酶的反应程序：变性（Denaturation）在95Ⰳ下变性30秒，让DNA双链解链成单链。这个步骤不需要修改，但变性时间可以根据模板的不同进行调整。退火（Annealing）在55Ⰳ下退火30秒，让引物通过碱基互补配对与单链DNA结合。退火温度可以根据引物的设计进行调整。延伸（Extension）在72Ⰳ下延伸1分钟，聚合酶开始合成新的DNA链。这个步骤一般不需要修改。循环数设置根据需要回收的片段大小，一般30个循环左右就够了。如果不需要回收，可以设置35个循环。其他步骤除了基本的PCR步骤，PCR仪还可以进行一些固定温度的孵育，比如37Ⰳ恒温酶切等操作。小贴士𐟓 枪头只沾到一点点液体也没关系，一般都能成功PCR。但还是要确认枪头有没有吸到相应的小体积液体。不同的酶延伸速度和温度可能不一样，需要根据具体情况调整。希望这些信息对你有所帮助！如果你有任何问题或需要进一步的指导，欢迎随时留言讨论哦！

PCR引物设计指南：让你的实验更高效！ 𐟔젥𜕧‰騮𞨮ᦘR实验的关键，以下是一些基本原则，帮助你设计出高效、特异的引物： 1️⃣ 引物长度：通常在15-30bp之间，大约20bp是最常见的选择。 2️⃣ 扩增跨度：理想的扩增跨度在200-500bp之间，但在特定条件下，可以扩增长达10kb的片段。 3️⃣ 碱基组成：G+C含量应在40-60%之间，太少会影响扩增效果，太多则容易产生非特异性条带。ATGC应随机分布，避免出现5个以上的嘌呤或啶核苷酸连续排列。 4️⃣ 避免二级结构：引物内部和两条引物之间应避免形成二级结构，特别是3'端的互补，以减少非特异性扩增。 5️⃣ 末端碱基配对：引物3'端的碱基，尤其是最末及倒数第二个碱基，应严格配对，以避免末端碱基不配对导致的PCR失败。 6️⃣ 酶切位点：引物中或能加上合适的酶切位点，被扩增的靶序列最好也有适宜的酶切位点，这对酶切分析或分子克隆非常有帮助。 7️⃣ 引物特异性：引物应与核酸序列数据库中的其他序列无明显同源性。每条引物的浓度应在0.1~1umol或10~100pmol之间，以最低引物量产生所需结果为佳，过高浓度会引起错配和非特异性扩增，并增加引物之间形成二聚体的机会。遵循这些原则，你的PCR实验将更加高效、准确！𐟒ᰟ”쀀

生物科学专业必备电脑配置清单𐟓‹ 大家好！作为即将踏入生物科学领域的小伙伴们，选择一台适合自己的电脑至关重要。今天，我们来聊聊哪些电脑配置更适合我们的专业需求。 𐟓Š 日常需求在学习过程中，我们会用到各种工具来辅助完成任务，例如： Office三件套（Word, Excel, PowerPoint）：用于撰写论文、处理实验数据和准备演讲课件。文献管理软件Endnote：用于收集、管理和引用文献资料。数据分析软件（如SPSS、Origin、GraphPad Prism）：帮助我们进行统计分析和图表制作。分子生物学软件SnapGene：进行DNA序列编辑和设计。基因分析软件Primer：用于设计引物和分析基因片段。化学绘图软件ChemDraw和KingDraw：绘制化学结构式。医学影像处理软件Mimics：用于三维重建和模型分析。编程语言（如C语言、Java、Python）：对于研究中的数据处理和建模工作非常重要。 𐟒𛠧ᬤ𛶩…置建议为了保证这些软件能够顺畅运行，我们需要关注以下几个硬件参数： CPU：中央处理器是电脑的大脑，对于运行复杂软件来说至关重要。推荐选择至少具有2.5GHz基础频率，且可以睿频至4.4GHz以上的处理器。核心数至少为六核，如果预算允许，八核或更多会更好。内存：由于我们常常需要同时打开多个程序，所以至少需要16GB的RAM。这样可以避免电脑因内存不足而卡顿。存储：建议选择512GB或更大容量的固态硬盘（SSD），最好是支持PCIe或NVMe协议的高速SSD，以保证文件读写速度快，系统运行流畅。显示屏：考虑到我们需要长时间盯着屏幕，因此建议至少选择15.6英寸大小的显示器，并且分辨率至少达到1080p（Full HD），更高分辨率如2K会更加清晰舒适。接口：确保你的电脑至少有两个USB 3.0端口，以便于连接外部存储设备或其他硬件。电源：选择80W或90W的大容量电池，以保证长时间的续航能力。 ⚠️ 注意事项最后，虽然Mac电脑在设计上很出色，但对于一些特定的生物科学软件可能存在兼容性问题，所以在选择时要慎重考虑。希望这份指南能帮助大家挑选到最适合自己的电脑！如果你觉得这篇文章对你有所帮助，请给一个小小的点赞作为支持哦！

PCR扩增常见问题及解决方法详解在进行PCR扩增实验时，可能会遇到各种问题，如片状涂抹带、引物二聚体、非特异性扩增等。以下是常见问题及解决方法：片状涂抹带可能原因：酶量过多或酶的质量差 dNTP浓度过高 Mg2+离子浓度过高退火温度过低循环次数过多解决方法：减少酶量或更换另一来源的酶降低dNTP浓度适当降低Mg2+离子浓度增加模板量，减少循环次数引物二聚体可能原因：引物设计不合理 PCR体系中含有杂质解决方法：优化引物设计使用高质量的PCR试剂和耗材非特异性扩增可能原因： PCR体系中含有杂质 PCR循环条件不合适解决方法：优化PCR循环条件使用高质量的PCR试剂和耗材其他常见问题除了上述问题外，还可能遇到PCR产物不纯、扩增效率低等问题。针对这些问题，可以通过优化PCR体系、调整PCR循环条件、使用高质量的PCR试剂和耗材等方法来解决。通过这些方法，可以有效解决PCR扩增实验中遇到的各种问题，提高实验结果的质量和可靠性。