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qPCR引物设计指南:轻松搞定引物设计! 大家好!最近是不是想我了?我回来啦!这段时间确实有点忙,发生了不少事情,但不管怎样,还是继续给大家带来实用的小技巧吧!今天我们来聊聊qPCR引物设计的那些事儿。 首先,做qPCR的第一步就是设计引物。市面上有很多设计引物的软件,但今天我要推荐一个我个人觉得非常好用且方便的软件——MRPrimerW2。这个网站支持九种物种的引物设计,简直是科研神器! 使用方法也很简单。你可以通过输入基因名或者fasta序列格式来设计引物。而且,这个网站还支持一次性输入多个基因,一次性设计出很多基因的引物,简直不要太方便! 更棒的是,这个网站还提供了自定义设置,方便我们设计出自己想要的引物。设计完之后,只需要点击primer search,就能检索到你想要的引物。 结果出来后,每个基因都会有相应的引物。你可以选择top 1、top 10或者top 50的引物评分来呈现结果。最后,别忘了在NCBI上进行复查,确保引物的准确性。 是不是觉得省时省力又省钱?祝大家科研顺利,结果完美!科研嘛,信其有不信则无,但有了好的工具和方法,成功的几率总是大一些的。加油!ꀀ
qPCR原理详解:实时荧光定量PCR 大家好,今天我们来聊聊qPCR(定量多聚酶链式反应)的原理。最近有点抑郁,加上药物作用,每天睡12小时,实在没精力更新。不过还是感谢大家的支持,下周有流式实验,到时候会拍操作界面的照片给大家详细讲解。 qPCR和传统PCR的主要区别在于检测方式。传统PCR只是对基因进行扩增,而qPCR则是实时检测底物的荧光强度来判断mRNA的表达量。这就引入了一个重要的概念:Ct值。 在qPCR中,基因的表达与荧光强度并不是线性关系,而是指数级增长(因为DNA的扩增是2^n次方)。因此,在某个循环时,荧光强度会达到一个阈值。当荧光强度超过这个阈值时,我们认为是高表达。到达这个阈值需要的循环数越少,基因的表达量就越高。这就是图2中曲线含义的解释(图片来源:Merck)。 有人可能会问,既然是mRNA的表达量,为什么说是DNA的扩增呢?这就要提到mRNA和cDNA的概念。空气中存在RNA酶,所以RNA在正常条件下极不稳定。即使是RNA-seq,也需要将RNA逆转录为cDNA。在生物学中,我们一般认为这两者的表达是一致的。 篇幅有限,下次再讲操作流程(RNA提取和引物设计等)。感谢大家的支持。
찟窠物理实验的常用仪器与软件一览 在基础物理实验室中,有许多常用的实验仪器和软件,帮助科学家们进行各种实验。以下是一些常见的实验方法和仪器: 基因鉴定:包括DNA提取、PCR体系、电泳技术等,用于研究基因敲除鼠、基因敲入鼠和点突变鼠等。 石蜡切片/冰冻切片:通过HE染色、免疫荧光和免疫组化等技术,观察细胞和组织结构。 qPCR:包括引物设计、RNA提取、逆转录和qPCR体系配置,用于定量分析基因表达。 Western blot (WB):从组织样本中提取蛋白质,通过制胶、电泳、转膜、孵抗体和曝光等步骤,检测蛋白质表达。 Elisa:用于微量蛋白或物质的定量分析。 细胞实验:包括细胞复苏、培养、传代、冻存、计数、转染以及细胞增殖/毒性实验、迁移实验、成管实验、免疫荧光染色、流式细胞术、细胞能量代谢实验、细胞周期检测实验和细胞凋亡实验等。 常用仪器:如离心机、涡旋混匀仪、普通显微镜、荧光显微镜、共聚焦显微镜、酶标仪、PCR仪、荧光定量PCR仪、流式细胞仪和海马仪等。 常用软件:包括统计软件如ImageJ、GraphPad Prism和SPSS,文献管理软件如EndNote和Zotero,绘图软件如Draw.io和PS,以及引物设计软件如Primer Premier 5和SnapGene。 通过这些仪器和软件,科学家们可以进行各种物理实验,探索自然界的奥秘。
如何设计qPCR引物:实用指南 大家好!今天我们来聊聊如何设计qPCR(定量PCR)的引物。其实,qPCR的引物设计和普通PCR差别不大,都可以用NCBI来方便地设计。不过,由于qPCR鉴定的是mRNA的表达,所以在设计引物时需要特别注意以下几点: 第一步:打开NCBI 首先,打开NCBI(美国国立生物技术信息中心)网站,搜索你需要的基因(例如Lepr)。 第二步:找到基因卡片 点开基因卡片,找到最下方的mRNA和Protein描述。根据你的需求选择合适的Isoform,然后复制NM码。 第三步:进入引物设计页面 在NCBI的引物设计(Primer design)栏目输入刚才复制的NM码。我个人更喜欢下载cDNA文件,然后用SnapGene手动拉取引物,这样可以直接看到cDNA序列,更加直观。 第四步:确认引物CG值 在SnapGene中确认引物的CG值(大约50%),Tm值在60度左右。可以多设计几对引物,以防有些引子不工作。 希望这些小技巧能帮到大家,祝科研顺利!ꀀ
科研必备:引物设计全攻略 在PCR实验中,引物设计至关重要。为了帮助科研人员更好地进行引物设计,这里为大家整理了一份详尽的引物设计资料,涵盖各种类型的引物设计方法。 砥騮 备软件:提供安装包和详细教程,助你轻松上手。 普通引物设计:从入门到精通的视频课程,让你快速掌握设计技巧。 젨ᨨ𝓥鯼详细介绍如何设计适用于表达载体的引物。 젱PCR引物:提供qPCR引物设计的全套攻略,包括实验设计和数据分析。 頃rispr-Cas9引物:涵盖Crispr-Cas9基因编辑技术的引物设计方法。 所有资料均包含详细的操作步骤和注意事项,确保你在科研实验中能够顺利应用。快来领取这份宝贵的资料吧!
점CR定制服务,提供qPCR检测、PCR代做、QPCR定制、引物设计、RNA提取、逆转录、数值分析等服务。 提供溶解曲线、扩增曲线、柱状图、CT值等实验数据,保证结果真实可靠。 保证数据唯一性,确保实验结果的真实性和准确性。 砥 括引物设计、RNA提取、逆转录等实验步骤,满足您的定制需求。 提供Amplification Plot和Melt Curve Plot,帮助您更直观地了解实验过程和结果。
접PCR的魔法原理揭秘 ✨ 你是否好奇QPCR是如何运作的?今天,我们就来揭开这个神秘的面纱! PCR,即聚合酶链式反应,是一种以DNA为模板,在DNA聚合酶的帮助下,体外合成DNA并不断扩增的过程。而QPCR,即定量PCR,是在PCR体系中加入了荧光染料或荧光探针,通过实时检测荧光信号来监测PCR进程。 ᠑PCR的原理是这样的:在PCR反应中,随着DNA的复制和扩增,荧光信号会逐渐增强。通过检测这个荧光信号的变化,我们可以知道DNA的复制情况,从而对模板进行定量的分析。 QPCR的流程包括:RNA提取、逆转录、引物设计、选择内参、模板用量和对照设置等步骤。每一个步骤都至关重要,确保了实验的准确性和可靠性。 通过QPCR,我们可以更精确地了解基因的表达情况,为生物研究和医学诊断提供了强大的支持!现在,你是不是对QPCR有了更深入的了解呢?
qPCR实验全流程详解,轻松搞定! 详细讲解qPCR实验的原理和步骤,助你轻松掌握! 一、实验步骤: 1️⃣ 提取核酸:从目标样本中提取DNA或RNA。 2️⃣ 反转录(针对RNA样本):将RNA转录成相应的cDNA。 3️⃣ 预处理:纯化提取的DNA/cDNA,去除污染物。 4️⃣ 设计引物和探针:设计特异性引物和荧光探针,与目标序列特异性结合。 5️⃣ 准备反应体系:按照说明书要求,配制引物、探针、模板、聚合酶、缓冲液等。 6️⃣ 执行PCR循环:将反应体系装入热循环仪并进行PCR循环。检测DNA变性、引物结合、扩增和荧光信号等。 7️⃣ 数据分析:根据荧光信号的变化,分析Ct值,计算目标序列的相对数量。 二、qPCR原理: qPCR(Real-time Quantitative PCR)即实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR),在PCR过程中加入荧光基团,根据荧光信号的变化实时监测扩增产物的变化。并通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析。 实时荧光PCR的产物不同,主要方法分为三种: 1️⃣ DNA结合染料法:与双链DNA小沟结合的荧光染料,不与单链DNA结合,与双链DNA结合会发出荧光,从而进行实时监测。 2️⃣ 探针化学法:荧光标记的探针与靶序列特异性结合产生荧光信号,利用荧光信号实时检测PCR扩增产物的变化。 3️⃣ 淬灭染料引物法:使用荧光标记引物扩增,使荧光标记基因掺入到PCR扩增产物中,从而利用荧光能量共振进行传递。 篇幅有限,完整电子版请自行获取~
젒T-PCR实验全攻略:从原理到实践 目录 cDNA与反转录 RT-PCR原理与目的 RNA抽提与质量检测 反转录过程 PCR程序与引物设计 PCR酶与体系 PCR产物检测 实时荧光定量PCR(RT-qPCR) 常见问题与注意事项 젣DNA与反转录 cDNA(互补DNA):与RNA链互补的单链DNA。在适当引物的存在下,由DNA聚合酶即反转录酶合成的单链DNA就是cDNA。 反转录(Reverse Transcription):在反转录酶的作用下,以RNA为模板合成DNA的过程。合成的DNA链称为与RNA互补的DNA,即cDNA。 젒T-PCR原理与目的 原理:RT-PCR全称反转录聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction),将RNA的反转录和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。 目的:检测核酸的表达,主要是RNA的表达。DNA不需要反转录的过程,直接PCR检测即可。 젒NA抽提与质量检测 RNA抽提方法:TRIzol法。主要成分包括苯酚,用于裂解细胞和变性蛋白。 RNA质量检测:分光光度计测定、凝胶电泳法。 젥转录过程 以RNA为模板合成cDNA的过程。在这个过程中,遗传信息的流动方向与转录时相反,因此称为“反转录”。需要反转录酶,合成的DNA称为与RNA互补的DNA(cDNA)。根据不同情况选择不同的反转录引物。 점CR程序与引物设计 PCR程序:三步法,包括变性、退火和延伸三个基本反应。 引物设计:找到目的基因的CDS序列,用软件设计和评价引物,并使用BLAST进行引物特异性检测。引物长度为15-30bp,最常用的为23bp;引物Tm值介于62-73℃之间,上下游引物Tm最好相近以保证其能高效工作;3'-端的Tm值要低于5'端;引物GC含量约为40-60%;避免扩增模板的二级结构域;避免引物的二级结构;避免与靶DNA错配。 점CR酶与体系 PCR酶:可选择普通的Taq酶、可扩增长片段的Taq酶或高保真酶。 PCR体系:按所选的PCR酶说明书来配制。 점CR产物检测 一般采用琼脂糖凝胶电泳,必要时也可使用聚丙烯酰胺凝胶电泳。 젥𖨍祅定量PCR(RT-qPCR) 基本原理:在PCR体系中加入能够指示DNA片段扩增过程的荧光染料或荧光标记的特异性探针,通过对PCR过程中产生的荧光信号累积或荧光标记的特异性探针释放的荧光信号进行监测和记录,实时监测整个PCR进程,再结合软件对获得的荧光信号数据进行分析,计算待测样品中特定DNA片段的初始量。 扩增过程:包括荧光背景信号阶段、荧光信号指数增加阶段和荧光信号平台期阶段。 常见问题与注意事项:在进行RT-PCR实验时,需要注意实验条件的选择、引物的设计、RNA的质量控制以及实验操作的规范性等问题,以确保实验结果的准确性和可靠性。
内参基因是什么意思 大家好,我想请教一下关于QPCR中内参基因和目的基因的问题。最近我在做实验时发现,内参基因的Ct值一般在29-30之间,而目的基因的Ct值在18-20之间。内参基因的Ct值明显高于目的基因,这让我有点困惑。 我查阅了一些资料,发现内参基因通常用于校正实验误差,确保目的基因表达量的准确性。然而,如果内参基因和目的基因的Ct值差异过大,可能会影响实验结果的可靠性。 有没有哪位大神能告诉我,这种情况是否正常?如果内参基因和目的基因的Ct值差异大,应该怎么处理?是否需要重新设计引物或者调整实验条件? 期待大家的宝贵意见,谢谢!
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