crispr 设计网站解读_张锋crispr设计网站网址(2024年12月精选)
学emo时的意外鼓励 这一天,我沉浸在Crispr cas基因编辑的世界里,感觉像是走进了一片未知的森林。实验的复杂性和高昂的费用让我感到压力山大,生怕因为自己的不熟练而导致实验失败。 于是,我一边在狼人杀里摸索,一边通过各种up主的讲解视频来寻求帮助。这些up主们真是太棒了,每个都讲得清晰明了,内容丰富,讲解循序渐进,简直是手把手地教我。相比之下,我在狼人杀里的发言简直像是在120秒内胡乱凑字数。 这些up主们的无私和耐心让我感到非常震撼。我甚至开始怀疑,是不是我也可以像他们一样,用心去教我的师妹呢? 其中一个up主分享了他使用的表达质粒,说这是美国一个科学家设计的。科学家!这个词在我小时候才听过。现在,只要发表一篇文章,分享一个自己设计的表达载体,就能被称为科学家了吗?在他们的眼里,这就算是科学家了? 这让我受到了极大的鼓舞。我也要努力成为科学家!无论学不会还是做不出来,我都会拼命去学、去做。我要像他们一样,用心、用爱去探索这个未知的世界。쀀
新加坡国立大学焦春磊课题组博士招生啦! 嘿,大家好!如果你对科研充满热情,想要在新加坡国立大学(NUS)找到一个充满挑战和机遇的环境,那么你来对地方了!我们焦春磊课题组正在寻找2025年8月入学的博士研究生,专门研究新型CRISPR系统的挖掘或对已有系统的设计改造。 招生条件 首先,你得是个积极主动的人,对科研有浓厚的兴趣,并且有良好的团队合作精神。你最好已经取得了硕士或本科学位,背景最好是AI、生物信息学或者蛋白质设计等方向。英语水平也要过硬,托福至少85分,雅思6.5分以上,GRE虽然不是强制要求,但有的话会更好。如果你有丰富的项目参与经验或者已经发表过科研论文,那更是加分项啦! 研究方向 슦们的研究方向主要是新型CRISPR系统的挖掘或者对已有系统的设计改造。这是一个充满挑战和机遇的领域,如果你对这个方向感兴趣,欢迎你来加入我们! 补贴和奖学金 𐊥 入我们,你将获得4年的全额奖学金,包括学费和生活津贴(每月大约2700-3200新币)。如果你表现优秀,还有机会获得医学院研究生奖学金(NUS Medicine Graduate Studies Award)或者校长奖学金(President’s Graduate Fellowship),这些奖学金的津贴会更高哦! 小贴士 እ詀择企业项目或者RA实验室的时候,一定要慎重考虑。秋招的时候也要多做准备,合理规划自己的时间和精力。在选择官方项目的时候,要充分了解项目的背景和前景,确保自己适合。最后,别忘了建立connection,这对你的科研和职业发展都非常关键。 如果你对更多细节感兴趣,欢迎随时联系我!期待你的加入!退
🦎⧴⥐成生物学的奇妙世界쥐成生物学,这门跨学科领域的研究,将生物学、工程学和计算机科学巧妙结合,致力于设计、构建和优化新型生物系统。它的目标是通过合成和修改DNA,利用生物体内的基因、代谢途径和细胞机制,创造出具有特定功能的生物体或生物分子。简单来说,就是将生命工程师化,让我们能够通过改造生物体来实现我们想要的目标。 𑥐成生物学在多个领域有着广泛的应用。在医药领域,它可以用于生产更安全、更有效的药物,甚至定制个体化治疗方案。在农业方面,合成生物学可以提高作物的产量和抗性,减少对化肥和农药的依赖,实现可持续发展。在环境保护方面,它可以帮助我们解决污染问题,清除有毒物质,甚至修复受损的生态系统。在能源和材料领域,合成生物学可以生产生物燃料和生物材料,替代传统的化石能源和塑料,降低对环境的影响。 ️合成生物学依赖于一系列先进的工具和技术。其中最著名的是CRISPR-Cas9基因编辑技术,它可以精确地编辑生物体的基因序列,实现基因的增删改。此外,还有合成基因组技术,可以人工设计和合成完整的基因组;合成生物学软件,可以模拟和优化生物系统的设计;生物传感器,可以监测环境中的生物和化学物质。这些工具和技术的不断进步,推动了合成生物学的发展,并为其应用提供了强大支持。 深入了解合成生物学的奇妙世界吗?欢迎关注我们的科普小课堂,探索更多有趣的例子和应用案例!
「护肤科技新思路」「素颜也有底气的护肤搭子」 我个人认为有几个方向可以尝试: 1、皮肤细胞研究; 2、基因编辑技术应用于化妆品研发(比如利用CRISPR/Cas9 等) 3、人工智能辅助设计配方或原料筛选 4、生物制造工艺优化 5、纳米材料制备及开发 6、新型智能设备 7、AI+大数据分析 8、医工交叉
科研必备:引物设计全攻略 在PCR实验中,引物设计至关重要。为了帮助科研人员更好地进行引物设计,这里为大家整理了一份详尽的引物设计资料,涵盖各种类型的引物设计方法。 砥騮 备软件:提供安装包和详细教程,助你轻松上手。 普通引物设计:从入门到精通的视频课程,让你快速掌握设计技巧。 젨ᨨ𝓥鯼详细介绍如何设计适用于表达载体的引物。 젱PCR引物:提供qPCR引物设计的全套攻略,包括实验设计和数据分析。 頃rispr-Cas9引物:涵盖Crispr-Cas9基因编辑技术的引物设计方法。 所有资料均包含详细的操作步骤和注意事项,确保你在科研实验中能够顺利应用。快来领取这份宝贵的资料吧!
【科学家开发基因组模型Evo 】美国斯坦福大学团队在《科学》杂志上发布一项开创性的研究成果——Evo。Evo 是一款基于大规模基因组数据训练的模型,旨在解码与设计 DNA、RNA 和蛋白质序列。该模型经过 3000 亿个 DNA 单位(token)的数据集训练,能够在单个碱基的精度上对长序列进行高效预测与生成,特别在跨物种基因预测方面表现出色。Evo 在合成多基因系统方面的成功率接近 50%,并且成功生成了经实验验证具有功能活性的 CRISPR-Cas9 蛋白。此外,Evo 在全基因组序列生成方面也展示强大的能力,所生成的序列在基因组结构、编码密度等方面与天然存在的基因组高度相似。Evo 不仅可以预测基因突变的影响,还能够生成完整的基因组序列,这为基因组设计、药物研发及生物工程技术的发展提供巨大的潜力。
biorxiv 分享一个上个月在BioRxiv上发表的CRISPR knockin协议。这个协议从gRNA设计、同源臂设计、克隆到编辑和选择都有详细的指导。最棒的是,作者优化了一系列的质粒,包括各种荧光标签、表位标签和TurboID。这些质粒设计了许多实用的酶切位点,方便根据需要进行替换和选择标记。这些质粒都可以在Addgene上直接购买。简直不要太方便! 砦谢Pelletier实验室,这对没有Knockin经验的学生来说真的是福音。如果你有Knockin的需求,强烈推荐看看这个协议。我自己还没用,等过一个月再来分享实际使用的感受! 协议的主要步骤包括: 设计gRNA和同源臂 克隆质粒 细胞培养 验证和选择 ️ 具体操作包括: 使用QIAGEN Plasmid Plus Midikit提取高质量的质粒DNA。 通过PCR扩增qTAG cassette,并使用Gibson Assembly进行四片段组装。 将组装好的质粒转入细菌中进行扩增,并使用QIAquick Gel Extraction Kit纯化质粒。 将纯化后的质粒转入细胞中进行编辑,并通过PCR和测序验证编辑结果。 这个协议不仅提供了详细的步骤,还解释了每个步骤的目的和注意事项。无论你是初学者还是有一定经验的科研人员,这个协议都能帮助你顺利完成CRISPR Knockin实验。
索尔克生物项目上线!速来 㰟㧔物专业的同学们看过来! 姴⥰克生物研究所的科研项目现在开放报名啦!如果你有需要名校教授的推荐信或者想要发表论文,那么这个项目你一定不能错过! 我适合参加这个项目吗? 如果你对分子神经生物学、神经生理学、神经病理学以及神经系统疾病研究感兴趣,并且有志于在这些领域进行理论方法创新,那么这个项目非常适合你。 课程简介 本项目的主要任务是研究神经系统在分子水平和系统水平上的变化过程,以及这些神经传导过程的整合作用,直至最复杂的高级功能。具体内容请看图哦。 项目大纲: ✨大脑和感官系统简介:视觉、嗅觉和听觉 ✨感官系统:视觉、嗅觉、听觉、味觉、触觉、体感皮层 ✨大脑空间感知:海马体构造与细胞、神经突触与递质路径、DNA和蛋白质分析 ✨系统发育:进化以及系统发育分析 ✨自闭症谱系障碍(ASD)神经系统疾病:疾病神经原理解析、CRISPR技术,基因治疗,RNA设计 导师介绍: Sreekanth导师现任索尔克生物研究所(Salk Institute for Biological Studies)终身教授,是美国生命科学领域成果最多、质量最高的研究机构之一,在生物医学研究机构与神经科学和行为学领域全球排名首位。他曾在《Nature》、《Neuron》、《Journal of Neuroscience》等国际期刊发表多篇学术论文。 项目结束后我可以收获什么? 6-7周在线小组科研+70小时论文答疑与辅导 10封授课教授定制推荐信(可用于网推) ⠅I/CPCI级别国际英文会议论文发表 项目研究报告+项目证书 总之,这次的项目是一次非常宝贵的科研机会,希望对大家有所帮助。
AI大模型开启基因组学新纪元 探索基因组的奥秘一直是生物科学的终极挑战。如何利用人工智能(AI)来解读DNA的复杂信息,并以此设计和操控生命的“程序代码”?斯坦福大学的Brian L. Hie团队在权威科学期刊《Science》上发表了一项开创性研究,介绍了一个名为Evo的大规模基因组基础模型。 Evo模型通过深度学习算法,不仅能够识别基因组中细微的模式,还能生成完整的基因序列,为基因编辑和新药开发提供了前所未有的支持。这个模型基于3000亿DNA token进行训练,能够在长序列的单碱基分辨率下进行预测和生成,尤其在跨物种的基因预测上表现优异。 Evo模型专注于捕捉生物学中的两个核心方面:中心法则的多模态性和进化的多尺度特性。中心法则揭示了DNA、RNA和蛋白质的统一信息流,而进化则跨越了分子、途径、细胞到生物体的各个层级。 研究发现,Evo生成的多基因系统成功率接近50%,生成的CRISPR-Cas9蛋白也经实验验证具有功能活性。此外,在全基因组生成方面,Evo生成的序列在基因组组织、编码密度和天然基因组方面显示出高度的相似性。 Evo不仅能预测基因突变的效应,还具备生成完整基因组序列的能力,在基因组设计、药物开发和生物工程领域具有广阔的潜力。
分子克隆实验指南:从零开始到成功 大家好!首先,非常感谢你们的关注和喜欢,真的很开心我的笔记能帮到大家。还记得最开始的那篇笔记,记录了我那次离谱的分子克隆实验,4个片段的同源重组竟然花了两个月!后来我慢慢发现,分子克隆其实非常微妙,有点像高中时的数学,学霸们轻而易举考100分,而我这种小学渣每次都在及格边缘反复横踩。所以,我想用这个账号记录我的科研日常,希望能和大家一起学习。 之前的几篇笔记中,我分享过引物设计、载体酶切、同源重组等非常具体的实验方法。但最近我发现,很多粉丝朋友们刚开启自己的科研之旅,或者是偏向临床的科研大佬们,对分子克隆实验整体了解比较少。所以今天,我想跟大家分享一下质粒构建的大体流程。 明确你的目标 斥 ,在构建质粒之前,你需要有一个清晰的计划。明确你要使用哪种克隆方法,比如同源重组、TOPO克隆还是T4连接。TOPO/TA克隆不需要同源臂,而同源重组和T4连接是需要同源臂的。 选择合适的载体 根据你的实验目的,选择合适的表达载体。例如,常用的原核表达载体有pET28a,真核表达载体有pcDNA3.1,CRISPR/Cas9表达载体有Lenti-V2等等。载体可以通过酶切或者环形PCR后,跑胶回收所需的载体片段。 设计引物并扩增片段 슦 选的构建方法,设计并合成引物。PCR扩增需要插入的目的片段,PCR的产物也需要通过跑胶回收。 连接与转化 将载体和目的片段连接后,转入合适的感受态细胞内。例如,DH5产生突变或者缺失,而Stable3相对更加稳定。但提质粒时需要使用试剂盒中的去蛋白液洗3遍,以充分去除核酸酶,减少后续对质粒酶切等实验的影响。通常连接产物的用量不超过总体积的1/20。然后在冰上静止20分钟,热激1分钟,再冰上静置3分钟,加入无抗的LB培养基,摇床摇40-60分钟,最后涂在合适抗性的LB平板上。 培养与鉴定 ꊌB板子放在37度培养箱内过夜生长,第二天挑取单克隆细胞,置于合适抗性的LB培养基中摇菌,然后提质粒送测序公司测序。如果你想偷懒的话,也可以直接送菌液到公司哦,菌液和质粒的测序价格是一样的。 今天就分享到这啦,希望这些内容对大家有用!如果有什么问题或者要补充的,欢迎评论或者私信哦!
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