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如何绘制韦恩图?一文搞定! 韦恩图(Venn diagram),也叫做文氏图,是一种广泛用于描述多个数据集之间交集、并集和差异的图形。通过图形之间的层叠关系,韦恩图可以清晰地展示集合与集合之间的相交关系,在各种类型的数据分析中都有着非常广泛的应用。 韦恩图的类型 韦恩图的类型有很多种,包括经典韦恩图、欧拉图、爱德华兹韦恩图、聚合和矩阵技术图等等。最常用的绘制工具是圆形,但制作韦恩图并不局限于使用圆形,还可以利用心形、椭圆、云朵、三角形等图形符号绘制。 如何绘制韦恩图? 虽然可以通过某些工具进行绘制,但对于复杂程度较高的韦恩图,可以通过一些方法来进行绘制,这可能会花费一些时间。推荐大家使用p5js来进行绘制,可以前往p5js开源社区进行学习。 绘制方法 绘制韦恩图的主要步骤包括:找到合适的图形、调整风格、设置透明度、添加文字等。具体操作可以根据自己的需求进行调整。 案例分享 组合标签筛选韦恩图是一种常见的应用场景。通过绘制维度一、维度二、维度三等不同维度的韦恩图,可以清晰地展示各个标签之间的关系。 总结 希望这篇文章能帮助你轻松绘制出漂亮的韦恩图!如果觉得有用,记得点赞、喜欢和收藏哦!
阅读教学中的思维可视化工具:让思考更清晰 阅读,不仅仅是文字的浏览,更是思维的碰撞。而“思维可视化”正是将这种碰撞显性化的关键。它通过语言、写作、绘画、建造等方式,将复杂的思维过程和内容直观地呈现出来,从而帮助我们更好地分析、反思和改进我们的思考方式。 在阅读教学中,思维可视化的工具被广泛运用,其中一些典型的工具包括: Story Map:这个故事地图非常适合用来分析故事类文本。学生们可以借助地图来复述故事,甚至进行角色扮演,让阅读变得更加生动有趣。 Venn Diagram(韦恩图):这种图表非常适合用来比较两种事物的异同。例如,在分析传统音乐和现代音乐的差异时,韦恩图可以帮助学生们更好地理解两者的关系,并鼓励他们基于图表进行概要写作,既分析了文本内容,又组织了写作思路。 Flow Map(流程图):流程图则适合用来展示一系列步骤。比如,如何制作纸雕、如何制作风筝等,通过流程图,学生们可以清晰地看到每个步骤的逻辑关系,从而更好地掌握制作方法。 ᠨ🙤维可视化工具不仅有助于学生们更好地理解文本,还能激发他们的创造力和批判性思维。通过这些工具的使用,阅读教学中的思维训练变得更加具体和高效。
网络药理学与分子对接全攻略 ### 网络药理学部分 药物成分与作用靶点检索 TCMSP、PubChem、SwissTargetprediction、Drugbank:这些数据库是查找药物成分和作用靶点的利器。 疾病相关靶点收集 GeneCards、OMIM、Disgenet:这些资源可以帮助你找到与特定疾病相关的靶点。 交集靶点与韦恩图获取 微生信、VNEEY:通过这些工具,你可以轻松获取交集靶点并绘制韦恩图。 PPI网络互作图与核心靶点绘制 STRING、Cytoscape、CytoNCA、Sentiscape:这些软件和插件可以帮助你构建PPI网络互作图,并找出核心靶点。 构建药物-成分-交集靶点-疾病图 Excel+Cytoscape:通过这些工具,你可以构建药物-成分-交集靶点-疾病图,并筛选出核心活性成分。 GO和KEGG富基条目获取 DAVID数据库、微生信:这些资源可以帮助你获取GO和KEGG的富基条目,并制作气泡图。 分子对接部分 슥体蛋白筛选与配体小分子选择 Autodocktools+pymol:通过这些工具,你可以筛选受体蛋白(即PPI中的核心靶点)与配体小分子(即“药物-成分-交集靶点-xx”中的核心活性成分)。 受体蛋白与配体小分子准备 PDB、OpenbabelGUI:通过这些工具,你可以下载受体蛋白PDB格式文件和配体小分子3D结构SDF并转PDB格式。 分子对接前处理 Autodocktools:配体小分子加氢+扭转,受体蛋白去水+加氢。 分子对接操作 Autodocktools:运行两次才能得到最终结果。 结果可视化处理 pymol:通过这些工具,你可以对分子对接的结果进行可视化处理。 结合能做热图 R语言、微生信:通过这些工具,你可以对结合能做热图。 分析部分 网络药理学分析 如何写好网络药理学?要对结果进行详细分析并讨论。 分子对接分析 如何写好分子对接内容?对结果如何分析与讨论? 通过这些步骤,你可以全面掌握网络药理学和分子对接的技巧,为药物研发和疾病治疗提供有力支持。
网络药理学:从零开始到毕业攻略! 想要顺利毕业?网络药理学来帮你!以下是详细步骤,助你轻松搞定毕业论文! 1️⃣ 明确药物与疾病:首先,确定你要研究的中药及其对应的疾病。这一步是基础,后续步骤都围绕它展开。 2️⃣ 查找药物成分:利用搜索引擎,输入“TCMSP”并搜索你的药名。如果找不到,就去文献中查找药物的成分,并尽可能多地找到成分。然后,可以通过smile号在swisstarge或super-PRED进行靶点预测。 3️⃣ 确定成分靶点:在TCMSP中找到你的药名后,利用口服利用度和类药性进行筛选。如果不是口服药,可以考虑其他筛选条件,如肠胃吸收等。如果找不到,可以通过pubchem网站找到相应的smile号,然后在swiss平台进行靶点预测。建议多找几个平台预测,取交集结果更可靠。 4️⃣ 确定疾病靶点:在OMIM、Genecards和Drugbank数据库中搜索你的疾病英文名,可以多找几种表达方式,然后去除重复,得到疾病靶点。 5️⃣ 找出交集靶点:画出韦恩图,确定药物成分和疾病靶点的交集。推荐使用venny2.1网站进行在线分析。 6️⃣ 构建PPI网络:将交集靶点蛋白导入String数据库,构建PPI网络。具体参数按需调整,然后下载PPI网络的tsv文件,导入cytoscape进行分析,利用cytoNCA插件进行排序,选取排名前五的靶点。 7️⃣ GO和KEGG分析:将交集靶点导入metascape网站,进行自定义分析。网站有详细指南,按照步骤操作即可。 8️⃣ 分子对接:根据PPI、GO和KEGG分析,选取与疾病最相关的靶点蛋白与对应的小分子进行对接,预测结合能。结合能小于-0.5表示对接良好。 9️⃣ 整理分析图:最后,整理分析结果,美化图片,如制作气泡图等。如果还想更深入分析,可以参考已发表的文献。 看到这里了,还不赶紧收藏起来!
韦恩图:市场营销的视觉利器 芥襸场营销的战场上,可视化图表就像是我们的“神兵利器”。今天,我们就来聊聊其中一种非常实用但又不太复杂的图表——韦恩图。 韦恩图是什么? 简单来说,韦恩图就是用圆形或其他几何形状来表示集合之间的交集和差集关系的图表。每个圆代表一个集合,而交集部分则显示了这些集合之间的共同元素,非交集部分则代表了集合的独特元素。 韦恩图的特点 交集展示:韦恩图能够清晰地展示不同集合之间的交集关系。 集合比较:它还可以用来比较不同集合之间的相同和不同之处。 可扩展性:通过组合多个圆形,可以表示更多集合的交集。 韦恩图的应用场景 关系:用于表示逻辑关系,例如在两个或多个条件同时满足时的情况。 市场定位:用于比较不同市场或产品的受众群体,找到共同和独特的目标受众。 数据集分析:用于展示数据集之间的相交和独立关系。 市场营销的使用场景 市场细分:可以用于细分市场,确定哪些客户同时符合不同的特定条件。 产品定位:用于比较不同产品或服务的特点,找到它们的共同和独特之处。 用户群体分析:用于分析不同用户群体之间的重叠和独立。 如何制作韦恩图? Lucidchart:提供在线绘制图表的工具,包括韦恩图的创建。 Microsoft PowerPoint:PowerPoint的SmartArt功能支持韦恩图的制作。 Python库(如matplotlib_venn):通过编程创建定制的韦恩图。 结语 ꊦ握韦恩图这个简单却强大的工具,你将在市场营销的战场上如虎添翼,赢得更多的胜利和掌声!让我们一起探索可视化的世界吧!
手帐制作小妙招:电子手帐与可视化结合✨ 越来越多的朋友开始使用手帐来记录生活点滴、规划时间,甚至记录心情和成长。无论是纸质还是电子,手帐都能成为我们生活的好帮手。 手帐的优点显而易见: 1️⃣ 灵活性高,记录形式多样。 2️⃣ 增强专注力和记忆力。 3️⃣ 促进自我成长,是规划生活的有力工具。 𘧄𖨀,一些知名品牌的手帐,如hobonichi、midori、LEUCHTTURM1917和Moleskine,价格不菲。再加上各种贴纸、保护套和彩绘笔,成本更是高昂。 此,许多朋友选择了电子手帐。电子手帐的模板和贴纸通常免费,使用起来非常方便。 说到电子手帐,强烈推荐大家尝试可视化记录。各种图表,如基础环图、基础条形图、分级区域地图、棒棒糖图和堆叠韦恩图,都能让你的手帐更加生动有趣。 想要了解这些图表的使用方法和如何将它们应用到手帐上?请继续关注,获取更多实用信息!
英文故事复述神器:5种可视化工具详解 今天为大家介绍几种帮助孩子快速复述英文故事的思维可视化工具。 使用思维可视化工具的优点: ✔️ 提炼:通过可视化工具快速提炼文本逻辑和重点 ✔️ 运用:利用可视化工具快速复述故事 ✔️ 迁移:结合新的情境,用可视化工具进行输出练习 常见的复述故事用的思维可视化工具: ♀️ 气泡图:用于描述事物的特性,例如分析嫦娥和后羿的性格特点; ♀️ 流程图:多用于描述事物的发展史或事情的经过,如轮滑鞋的发展史,柠檬水的制作; ♀️ 括号图:用于分析整体和局部,如介绍皮肤的特效和功能; ♀️ 韦恩图:多用于比较事物的异同,如猫和狗的相似点和不同点; ♀️ 5W1H:从why, what, when, where, who, how六个方面分析事物,如介绍化石。 通过这些工具,孩子们可以更系统地理解和复述英文故事,提升他们的英语表达和思维能力。
韦恩图:市场营销的隐形神器 覕𐦍﨧化的世界里,韦恩图(Venn Chart)绝对是一个隐藏的“神兵利器”。今天,我就来聊聊这个看似简单但实则强大的工具。 什么是韦恩图? 韦恩图是一种用圆形或其他几何形状来表示集合之间交集和差集关系的图表。每个圆代表一个集合,而圆之间的交集部分则表示这些集合之间的共同元素,非交集部分则表示集合的独特元素。 韦恩图的特点 交集展示:韦恩图能够清晰地展示不同集合之间的交集关系。 集合比较:它还可以用来比较不同集合之间的相同和不同之处。 可扩展性:通过组合多个圆形,可以表示更多集合的交集。 韦恩图的用途 关系:韦恩图常用于表示逻辑关系,例如在两个或多个条件同时满足时的情况。 市场定位:它在比较不同市场或产品的受众群体时非常有用,能帮助你找到共同和独特的目标受众。 数据集分析:韦恩图还能展示数据集之间的相交和独立关系。 市场营销的使用场景 市场细分:韦恩图可以用于细分市场,确定哪些客户同时符合不同的特定条件。 产品定位:通过比较不同产品或服务的特点,找到它们的共同和独特之处。 用户群体分析:它还能用于分析不同用户群体之间的重叠和独立。 如何制作韦恩图? Lucidchart:这是一个在线绘制图表的工具,支持韦恩图的创建。 Microsoft PowerPoint:PowerPoint的SmartArt功能也支持韦恩图的制作。 Python库:如果你喜欢编程,可以使用matplotlib_venn等Python库来创建定制的韦恩图。 结语 ꊦ握韦恩图这个简单却强大的工具,你将在市场营销领域成为超级英雄!无论是市场细分、产品定位还是用户群体分析,韦恩图都能帮你赢得胜利。让我们一起探索可视化的世界吧!
网络药理学与分子对接全流程详解 嘿,大家好!今天我想跟大家聊聊网络药理学和分子对接的那些事儿。说实话,做这些工作确实有点繁琐,但只要你跟着步骤来,其实也没那么难。下面我会详细讲解每一个步骤,希望能帮到你们。 网络药理学部分 药物成分与作用靶点检索 首先,你需要找到药物的成分和它们的作用靶点。这里有几个常用的数据库:TCMSP、PubChem、SwissTargetprediction和Drugbank。这些数据库都能帮你找到药物的相关信息。 收集疾病相关靶点 接下来,你需要收集与疾病相关的靶点。GeneCards、OMIM和Disgenet是几个不错的选择。这些数据库能帮你找到与特定疾病相关的基因和靶点。 获取交集靶点与韦恩图 然后,你需要找到药物成分和疾病靶点的交集,并绘制韦恩图。微生信和VNEEY是两个不错的工具。通过这些工具,你能直观地看到药物成分和疾病靶点的关系。 绘制PPI网络互作图与核心靶点 接下来,你需要绘制PPI网络互作图和核心靶点。STRING、Cytoscape以及Cytoscape的插件CytoNCA和Sentiscape都能帮你实现这一点。这些工具能帮你看到蛋白质之间的相互作用关系。 构建药物-成分-交集靶点-疾病图 你可以构建“药物-成分-交集靶点-疾病”图,或者只构建“药物-成分-成分所对应的靶点”图,并筛选出核心活性成分。Excel和Cytoscape是两个很好的选择。通过这些工具,你能更清晰地看到药物与疾病之间的关系。 获取GO和KEGG的富基条目 最后,你需要获取GO(基因本体)和KEGG(京都基因与基因组百科全书)的富基条目,并制作气泡图。DAVID数据库和微生信是两个不错的选择。这些工具能帮你看到基因和靶点的功能分类和富集情况。 分子对接部分 슧훩受体蛋白与配体小分子 首先,你需要筛选受体蛋白(即PPI中的核心靶点)和配体小分子(即“药物-成分-交集靶点-xx”中的核心活性成分)。这个过程有点繁琐,但只要你耐心点,还是能搞定的。 下载受体蛋白PDB格式文件和配体小分子3D结构SDF 接下来,你需要下载受体蛋白的PDB格式文件和配体小分子的3D结构SDF文件,并将其转换为PDB格式。PDB和OpenbabelGUI是两个不错的选择。这些工具能帮你轻松处理蛋白质和分子的结构数据。 分子对接前处理 在进行分子对接前,你需要对配体小分子进行加氢和扭转操作,对受体蛋白进行去水和加氢操作。Autodocktools是这里的关键工具。通过这些操作,你能让分子对接过程更加顺利。 分子对接过程 分子对接过程需要运行两次才能得到最终结果。这个过程有点复杂,建议你们多看视频教学,文字笔记太多啦。Autodocktools是这里的关键工具。 可视化处理和对结合能做热图 最后,你需要对分子对接的结果进行可视化处理和对结合能做热图分析。pymol和R语言是两个不错的选择。通过这些工具,你能更直观地看到分子对接的结果和分析数据。 分析部分 写好网络药理学和分析结果 首先,你需要写好网络药理学的分析结果。讨论部分很重要,要详细解释你的发现和分析过程。 写好分子对接内容和分析结果 接下来,你需要写好分子对接的分析结果。讨论部分同样重要,要详细解释你的发现和分析过程。 总结 以上就是网络药理学和分子对接的基本步骤和工具介绍啦!希望这些信息能帮到你们,让你们在做科研的过程中少走弯路。如果有任何问题或需要更多帮助,欢迎随时留言哦!
肠道微生物宏基因组学:从数据到洞见 🠨 道微生物组学:探索肠道的奥秘 肠道微生物组学是一个充满挑战和机遇的领域,它涉及人类肠道微生物的基因参考集、培养组学以及肠道病毒组的研究。通过深入探索这些微生物与宿主之间的相互作用,我们可以更好地理解肠道健康和疾病的关系。 젨 道微生物组学的研究方法 슊1️⃣ 扩增子测序:通过PCR技术对特定基因进行扩增,然后进行测序。 2️⃣ 宏基因组测序:直接对肠道微生物的基因组进行测序,获取更全面的信息。 堧 究热点 劊1️⃣ 肠菌与疾病的关系:探索肠道微生物如何影响宿主健康。 2️⃣ 宏基因组关联分析(MWAS):通过宏基因组数据来预测疾病风险。 3️⃣ 多组学联合分析:结合基因组、转录组、蛋白质组等多组学数据,全面解析肠道微生物的功能和作用。 栨 道微生物组学测序的实验设计 把1️⃣ 样品制备:确保样品的代表性,避免污染。 2️⃣ 实验重复:增加实验的可重复性,确保数据的可靠性。 3️⃣ 测序数据量:选择合适的测序深度,以获得足够的信息。 4️⃣ 对照组设计:正确设置实验组和对照组,以便进行差异分析。 5️⃣ 注意事项:避免样品制作和建库中的常见误区。 肠道微生物组学分析的结果解读 1️⃣ 原始数据评估:确保数据的准确性和完整性。 2️⃣ 组装结果质量评估:评估组装结果的准确性。 3️⃣ 16S rRNA分析:通过alpha/beta多样性、稀释曲线、物种组成等来了解肠道微生物的多样性。 4️⃣ 组间差异分析:通过相关性、PCA、PCoA、RDA/CCA等分析方法,比较不同组别之间的差异。 5️⃣ 功能通路富集分析:通过差异物种和功能通路的富集分析,揭示微生物的功能差异。 6️⃣ 热图展示:通过热图展示差异物种和功能通路的富集情况。 7️⃣ 韦恩图和LEfSe分析:通过韦恩图和LEfSe分析,进一步了解差异菌群的特征。 蠩똧析与可视化实战 芊1️⃣ R语言基础及其在生物信息学中的应用:学习R语言的基础知识,并掌握其在生物信息学中的应用,如QIIME结果解析、稀释曲线绘制、物种丰度图绘制、差异菌群分析、热图分析、PCA/PCoA分析等。 2️⃣ 常用分析软件介绍:了解并掌握MEGA、Evolview、LEfSe、PICUST、STAMP、Cytoscape、ResFinder等常用软件的使用方法。
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